药物设计平台 Cresset-BMD Flare v9.0.0破解版

Cresset-BMD Flare 是一个全面的药物设计平台，包括基于结构和基于配体的方法。

Flare V9 中的功能包括：

• 蛋白质-配体复合物的智能导入和处理
• 准确可靠的蛋白质制备
• 配体制备，包括立体中心计数、盐剥离、pH 7 下的质子化和互变异构体计数
• 序列比对和叠加
• 使用 Lead Finder 进行精确对接
• 先进的基于配体的构象狩猎和比对
• 使用 FieldTemplater 构建药效团
• 静电互补图和评分
• 蛋白质相互作用的潜力
• 使用 Activity Atlas 和 Activity Miner 进行定性构效关系分析
• 使用现场 QSAR 和机器学习方法进行回归和分类的定量 SAR 模型
• 枚举以基于 100 多种常用合成化学反应生成文库和阵列
• 使用 Hit Expander 对胶化合物或先导化合物进行化学勘探
• R 群分解和分析
• 使用 Spark 的支架跳跃和生物等排体更换
• 分子动力学/广义出生表面积 （MM/GBSA） 单个蛋白质构象或构象集合上配体-蛋白质结合自由能的计算
• 配体的量子力学计算
• Free Energy Permorbation 模拟
• 支持 Open Force Field
• 分子动力学
• 自动创建配体的自定义扭转参数，以支持动力学和 FEP 计算
• 3D-RISM 水分析
• 使用 GIST 进行基于 MD 的水热力学分析
• 口袋检测，用于识别目标蛋白质靶标中的潜在药物结合位点
• 同源建模，为感兴趣的靶标创建可靠的 3D 结构
• 用于配体和结合位点能量学的 WaterSwap 分析
• 使用 XED 和 OpenMM 最小化蛋白质配体复合物
• The Flare Python API